事業承継引継ぎ補助金 2026｜M&A時の専門家費用を最大600万円補助

2026年4月26日

丸山桃子

この記事のポイント

✓事業承継引継ぎ補助金 2026の最新情報を解説
✓第14次公募の申請期間
✓補助上限600万円の条件

「事業承継引継ぎ補助金 2026」と検索してこのページに辿り着いた方は、おそらく親族や知人の中小企業をM&Aで引き継ぐ予定があるか、あるいは自分のスモールビジネスを誰かに譲りたい、もしくは廃業を含めて事業の出口戦略を考えている段階だと思います。アパレルや小売の世界でも、ここ数年「後継者不在で店を閉める」「ブランドを売却する」というニュースが本当に増えました。本記事では、最大600万円まで補助される事業承継・M&A補助金（旧:事業承継・引継ぎ補助金）の2026年最新情報を、申請枠ごとの違い・採択率・スケジュール・実務の落とし穴まで、客観的なデータで整理します。

事業承継引継ぎ補助金 2026の全体像と名称変更の背景

まず最初に押さえておきたいのが、補助金の正式名称が変わったという事実です。かつて「事業承継・引継ぎ補助金」と呼ばれていたこの制度は、2025年度（令和7年度補正予算）から「事業承継・M&A補助金」へと名称が改められました。検索ボリュームの関係で旧名称で調べる方が多いのですが、公募要領や採択結果の発表は新名称で出ているため、情報収集の際は両方のキーワードを使うのが効率的です。

この制度は中小企業庁が所管する「中小企業生産性革命推進事業」の一翼を担う補助金で、IT導入補助金・ものづくり補助金・小規模事業者持続化補助金と並ぶ国の主要4補助金のひとつです。事業承継やM&Aを実施する中小企業・小規模事業者に対し、設備投資・専門家活用・PMI（経営統合作業）・廃業の各フェーズで発生する費用を最大600万円まで補助します。

名称変更の背景には、近年のスタートアップ界隈や中堅企業を含めたM&A市場の拡大があります。中小企業庁の調査によれば、後継者不在率は依然として50%を超えており、親族内承継だけでは事業を残せない時代になりました。第三者承継、つまりM&Aによる事業引継ぎを国として後押しする姿勢が、補助金の名称にも反映されているわけです。

14次公募の採択者を決定いたしました。・申請件数：512件（うち、事業承継促進枠169件、専門家活用枠299件、PMI推進枠43件、廃業・再チャレンジ枠1件）・採択件数：311件（うち、事業承継促進枠103件、専門家活用枠180件、PMI推進枠27件、廃業・再チャレンジ枠1件）

この数字を見ると、第14次公募の採択率は約61%。他の補助金（IT導入補助金で30〜40%、ものづくり補助金で40〜50%程度）と比較しても通りやすい部類に入ります。後継者不在の社会課題解決という政策目的が強く、国も採択数を確保したい意図が透けて見えるデータです。

4つの支援枠を徹底解剖｜どの枠で申請するべきか

事業承継・M&A補助金は、申請者の置かれている状況に応じて4つの枠から選びます。ここを間違えると審査の入口で弾かれるので、慎重に判断する必要があります。

1. 事業承継促進枠｜承継後の設備投資・新分野挑戦に

事業承継促進枠は、事業承継を実施した中小企業が、新しい取り組みのために行う設備投資・販路開拓・新分野挑戦の経費を補助する枠です。補助上限は最大800万円（賃上げ要件達成時の上乗せ含む）、補助率は1/2〜2/3。

対象経費は店舗改装費・機械装置の購入費・広報費・外注費・委託費など幅広く、承継後の経営革新を実質的に下支えする内容です。私がアパレルECの現場で見ている範囲でも、地方の老舗呉服店を承継した二代目が、この補助金を使ってECサイト構築費を捻出するケースが増えています。「親父の代までは店舗だけで回せた、でも自分の代ではECなしでは無理」という現場の声と制度設計が、うまく噛み合っている枠です。

2. 専門家活用枠｜M&Aの仲介手数料・DD費用を補助

専門家活用枠は、M&Aの売り手・買い手双方が利用できる枠で、補助上限は最大600万円、補助率は1/2〜2/3です。

対象になる経費は、M&A仲介手数料・FA（ファイナンシャルアドバイザー）費用・デューデリジェンス費用（DD費用：法務・財務・税務調査の費用）・表明保証保険料・セカンドオピニオン費用など。中小M&Aの仲介手数料は案件によっては数百万円〜1,000万円規模になるため、補助対象になるかどうかでM&Aの成立可否が変わるケースも珍しくありません。

注意点として、利用できるM&A支援機関は中小企業庁が運営する「M&A支援機関登録制度」に登録された機関に限定されます。仲介会社を選ぶ時点で登録番号を確認しないと、後から補助金が下りないという事故が起きるので必ずチェックしてください。

3. PMI推進枠｜M&A後の統合作業を最大600万円補助

PMI推進枠は2024年度から本格化した枠で、M&A成立後の経営統合（Post Merger Integration）に必要な費用を補助します。補助上限は最大600万円、補助率は1/2〜2/3。

M&Aは契約成立がゴールではなくスタートだと言われます。買収後に売り手側の従業員が離職したり、システム統合に失敗したりして、想定していたシナジーが出ないケースが業界では頻発しています。PMI推進枠は、まさにこの「買収後の苦しみ」をサポートする枠で、外部コンサルタントへの委託費・人材育成費・システム統合費などが対象になります。

第14次公募での申請件数はまだ43件と少なく、認知度が低い枠ですが、制度としては非常に重要な位置づけにあります。

4. 廃業・再チャレンジ枠｜出口戦略にも国が補助

廃業・再チャレンジ枠は、M&Aや事業承継ができずに廃業を選ぶ事業者、あるいは廃業後に再チャレンジする事業者を対象とした枠です。補助上限は最大150万円、補助率は2/3。

対象経費は廃業に伴う在庫処分費・解体費・原状回復費・専門家相談費など。アパレル業界で言えば、店舗を閉める際の什器処分や原状回復費は数十万〜数百万円かかるのが現実で、この負担で廃業の決断ができないまま赤字を垂れ流す経営者も多いんです。出口戦略にも補助が出るという発想は、廃業=失敗という日本特有の価値観を変える政策メッセージでもあります。

第14次公募のスケジュールと採択率の最新傾向

2026年に申請を予定している方が最も気にするのが、公募スケジュールと採択率です。

なお、第14次公募の受付期間は2026年2月27日から4月3日17時までとなっています。GビズIDの発行には通常2〜3週間程度かかる場合があります。

第14次公募は2026年2月27日〜4月3日17時までという約5週間の受付期間でした。年間2〜3回の公募が行われる見込みで、15次・16次公募も2026年中に予定されています。最新情報は中小企業庁（中小企業庁公式サイト）と中小機構（中小機構公式サイト）で随時更新されます。

採択率について整理しておくと、第14次公募の枠別採択率は以下の通りです。

支援枠	申請件数	採択件数	採択率
事業承継促進枠	169件	103件	約61%
専門家活用枠	299件	180件	約60%
PMI推進枠	43件	27件	約63%
廃業・再チャレンジ枠	1件	1件	100%
合計	512件	311件	約61%

注目すべきはPMI推進枠の採択率が他枠より高い点。申請件数が少ないため統計的なブレはありますが、制度として推進したい枠は通りやすいという傾向は他の補助金でも共通して見られます。狙い目の枠と言えるでしょう。

申請の準備手順｜GビズIDから事業計画書まで

申請を実際に進める際の手順を、フリーランスとしてクライアントの補助金申請支援に関わってきた経験を踏まえて整理します。

Step1. GビズIDプライムの取得（最重要）

事業承継・M&A補助金は電子申請のみ受付で、GビズIDプライムというデジタル認証が必須です。GビズIDの発行には通常2〜3週間かかります。公募開始から締切までが5週間程度しかないため、GビズIDを持っていない状態で公募開始を待っていると、間に合わないリスクが極めて高いです。

私が以前関わった案件でも、申請直前にGビズID未取得が発覚し、結果的に1回見送りせざるを得なくなったケースがありました。事業承継を視野に入れているなら、補助金を使うかどうか確定する前にGビズIDだけは取得しておくのが鉄則です。

Step2. 認定経営革新等支援機関への相談

事業承継促進枠やPMI推進枠では、認定経営革新等支援機関（認定支援機関）の確認書が申請に必要になります。認定支援機関は税理士・中小企業診断士・金融機関などが該当し、検索ポータルで地域別に検索できます。

中小企業診断士の役割がここで非常に重要で、補助金申請支援は診断士のメインフィールドのひとつです。中小企業診断士という資格自体の概要は中小企業診断士のページにまとまっていて、独立してこの分野で活動する人も増えています。フリーランスの中小企業診断士に支援を依頼するという選択肢も、最近は現実的になってきました。

Step3. 事業計画書の作成

採択を勝ち取る上で最大の山場が事業計画書の作成です。審査では「経営力の向上」「地域への波及効果」「実現可能性」「賃上げ計画」などが評価項目になっており、単に「設備を買いたい」だけでは通りません。

事業計画書の作成にはWebライターやコピーライターのスキルが活きる場面も多く、補助金申請書の代筆を専門にしているフリーランスも存在します。実際の単価感は著述家，記者，編集者の年収・単価相場を見ると参考になりますが、補助金申請書の代筆は通常のライティングよりも単価が高めに設定されているのが業界の実情です。

Step4. 必要書類の収集と電子申請

申請時に必要な主な書類は以下の通りです。

・GビズIDプライムアカウント・履歴事項全部証明書（法人の場合）・直近2期分の確定申告書または決算書・認定支援機関による確認書・M&A支援機関の登録番号（専門家活用枠の場合）・事業計画書・経費明細書・見積書（外部発注分）

書類不備で受付されないケースが毎回一定数あるため、申請直前の最終チェックは必ず複数人の目で行うべきです。

採択率を上げるための実務的なポイント

「採択率61%なら、申請すれば通る」と楽観する方もいますが、実際は審査評価点の差で当落線上に乗るかどうかが決まります。採択率を上げるために押さえておきたいポイントを整理します。

ポイント1. 賃上げ要件で補助上限を引き上げる

事業承継促進枠では、賃上げ要件（給与支給総額の年率平均+1.5%以上、または事業場内最低賃金を地域別最低賃金+30円以上にする等）を達成すると、補助上限が引き上げられます。賃上げに前向きな企業は、それだけで政策評価点が高くなる傾向があります。

ポイント2. 数値根拠のある事業計画を作る

「売上が上がります」「効率化されます」だけの計画書は審査で評価されません。「販路をECに広げることで、3年後に売上を130%に伸ばす」「設備投資により製造リードタイムを40%短縮する」など、定量的な数字を必ず入れる必要があります。

私の体験で言うと、初めて補助金申請の事業計画書作成を手伝った時、「いい感じに書けた」と思っていた原稿を中小企業診断士の方にレビューしてもらったら、「数字が一切ない、これは作文だ」とバッサリ斬られました。マクロ統計（市場規模・成長率）、自社のKPI（CVR、リピート率）、競合ベンチマークまで数字で固めて、ようやく審査される土俵に上がれる感覚です。

ポイント3. 加点項目を漏らさず申請する

事業承継・M&A補助金には加点項目があり、これを取りこぼすと採択率が大きく落ちます。代表的な加点項目は以下です。

・経営力向上計画の認定・地域未来牽引企業への選定・パートナーシップ構築宣言の公表・健康経営優良法人の認定・くるみん認定・えるぼし認定

特にパートナーシップ構築宣言はオンラインで申請でき、認定までの時間も短い割に加点幅が大きいので、加点漏れの定番アイテムです。

ポイント4. M&A支援機関の選定を慎重に

専門家活用枠を使う場合、M&A支援機関の選び方が成否を分けます。中小M&A業界では仲介手数料の透明性問題が議論されており、悪質な仲介事例も報じられています。中小企業庁の登録番号を持っている機関の中でも、業界経験・成約実績・手数料体系を必ず複数社比較してください。

補助金申請支援は中小企業診断士のメイン業務

中小企業診断士の資格情報については中小企業診断士のページに概要がまとまっています。これから取得を目指す方にとって、補助金支援は資格取得後の代表的なキャリアパスのひとつと言えます。

事業計画書の代筆ニーズが拡大中

事業計画書の作成代行は、Webライター・編集者として独立したフリーランスにとって新しい収益源です。一般的な記事ライティングが1文字1〜3円程度なのに対し、補助金申請書の代筆は1案件10万〜50万円規模になることもあります。

ライティング系の単価感や仕事の探し方はAI・マーケティング・セキュリティのお仕事や著述家，記者，編集者の年収・単価相場で確認できます。AI時代に入ってからは、ChatGPT等を活用した下書き作成→人手で数字とロジックを整えるという分業スタイルが定着し始めています。

M&A後のシステム統合・DX支援にエンジニア需要

PMI推進枠の対象経費には、システム統合や業務プロセスの再設計に関わる外部委託費が含まれます。フリーランスエンジニアにとって、M&A後の旧システムから新システムへの移行支援、データ統合、業務システム刷新などは大きな案件機会になります。

具体的な業務範囲やニーズはアプリケーション開発のお仕事に詳しくまとまっていますが、最近の傾向としてはAIエージェントを活用した業務効率化支援とセットで案件化するケースが増えています。AI関連の業務支援についてはAIコンサル・業務活用支援のお仕事でも触れています。エンジニアの年収相場はソフトウェア作成者の年収・単価相場を参考にしてください。

介護・福祉領域での事業承継ニーズの増加

事業承継問題は介護・福祉領域で特に深刻です。経営者の高齢化・後継者不在・人手不足が三重苦になっており、M&Aによる事業統合が進んでいます。介護業界のDX化を支援する補助金については介護・福祉事業所のDX化2026｜IT導入補助金で介護記録を完全デジタル化で詳しく解説しています。

また、介護施設の送迎バス安全装置に関する補助金は送迎バス安全装置の設置補助金2026｜介護施設の義務化対応と申請手順、介護タクシーの開業支援については介護タクシー開業ガイド2026｜助成金と補助金で開業費用を 1/3 にする方法にまとめています。事業承継・M&A補助金と組み合わせて活用する選択肢が広がっています。

医療事務分野の事業承継

医療機関の事業承継も大きなテーマです。後継者不在のクリニックを医療法人がM&Aで承継するケースが増えており、医療事務スタッフの再雇用・業務プロセスの統合などPMI領域での需要が拡大しています。医療事務系の資格情報は医療事務技能審査試験（メディカルクラーク）にまとまっており、M&A後の体制再構築にも関わる職種です。

マクロ視点｜事業承継市場の今後

帝国データバンクの調査によれば、後継者不在率は約53%（2024年時点）と依然として高水準です。中小機構の集計では、2025年以降に経営者が70歳を超える中小企業は約245万社に達するとされ、その半数で後継者が決まっていないと推計されています。

つまり「事業承継引継ぎ補助金 2026」というキーワードで検索する人は、今後5〜10年で確実に増えます。フリーランスとして、この巨大な市場の周辺業務（補助金申請支援・事業計画策定・M&A後の業務統合・DX支援）に関わる機会は十分にあります。「補助金は申請者向け」と捉えるか、「補助金市場全体に関わる仕事を取りに行く」と捉えるかで、フリーランスとしての可能性は大きく変わるはずです。

よくある質問

Q. 事業承継・引継ぎ補助金は、具体的にどのような費用が補助の対象になりますか？

M&Aや事業承継に伴う専門家経費が主な対象です。具体的には、FA（フィナンシャルアドバイザー）や仲介業者への謝礼、デューデリジェンス（資産査定）費用、企業価値評価のための税理士や公認会計士の報酬、譲渡契約書の作成に関わる弁護士費用などが含まれます。ただし、補助金の交付決定前に契約・発注した費用は原則対象外となるため、必ず申請スケジュールを確認し、採択決定後に契約を進めるのが鉄則です。

Q. 採択率を上げるために、事業計画書で特に強調すべきポイントは何ですか？

経営資源の引継ぎによる「生産性の向上」や「新たな付加価値の創出」を具体的に示すことです。単に「事業を引き継ぎます」というだけでなく、既存の顧客基盤と譲受企業の強みを掛け合わせることで、どのように売上を拡大し、地域経済や業界に貢献できるかを数値目標と共に記述してください。また、専門家による適正なM&Aプロセスを経て、リスク管理ができている体制であることを証明すると評価が高まります。

Q. 申請にはどの程度の準備期間が必要ですか？

少なくとも1ヶ月以上の余裕を持って準備を始めることを強く推奨します。必須となる「GビズIDプライム」の発行に数日〜1週間程度かかるほか、事業計画書の作成には、直近の決算書や譲渡側の経営状況の分析など膨大な資料収集が必要です。公募期間は短期間であることが多いため、申請直前に慌てないよう、あらかじめ税理士や中小企業診断士などの専門家に相談し、ドラフトを早めに作成しておくことが採択の近道です。

Q. 複数の支援枠があるようですが、自分に合う枠の選び方はありますか？

事業の状況に応じて最適な枠を選び### Q1. 事業承継・引継ぎ補助金の最大600万円を受け取るにはどんな条件が必要ですか？最大600万円の補助を受けるには、「経営革新事業」の枠で、M&Aや事業承継後に新たな経営革新に取り組む計画が必要です。具体的には、専門家への謝礼金や旅費、事業譲渡・譲受の際の仲介手数料などが対象となります。単に事業を引き継ぐだけでなく、引き継いだ経営資源を活用し、売上向上や販路開拓など、具体的な事業計画を策定して採択されることが必須条件です。

Q. 申請の難易度は高いですか？採択率の傾向を教えてください。？

採択率は概ね60%前後で推移しており、しっかりと準備すれば十分狙える補助金です。ただし、事業計画書に「なぜこのM&Aが必要なのか」「事業を引き継いでどう成長させるのか」というストーリーと、客観的な数値目標を明記する必要があります。専門家費用が補助対象のため、税理士や中小企業診断士など、補助金申請に強い専門家と一緒に計画を練り上げることが採択への近道です。

Q. フリーランスや個人事業主でも申請の対象になりますか？

はい、個人事業主やフリーランスの方も対象となります。ただし、事業譲受（M&A）や事業承継を伴うことが前提となるため、法人化を検討している方や、他社の事業の一部を譲り受けて規模を拡大したい方には非常に有効です。GビズIDプライムアカウントの取得が必須ですので、検討中であれば早めに準備を始めましょう。審査では、事業の継続性や発展性が厳しく問われます。

Q. 申請準備において、まず何から始めるべきですか？

まずは「GビズIDプライム」アカウントの取得から始めてください。ID発行には数日〜数週間かかるため、直前だと公募に間に合いません。次に、自社の課題を整理し、補助金を活用してどの専門家からどのような支援を受けたいかを明確にします。公募要領を読み込むだけでなく、過去の採択事例を参考にし、自社の計画が各支援枠の目的に合致しているかを確認するのが成功のポイントです。